学校1981年开始招收和培养研究生，1997年开始招收专业学位研究生，2008年成立研究生学院。学校一直以建设省内一流、国内知名师范大学为目标，积极推动学位与研究生教育事业发展。
研究生学院成立以来，哈尔滨师范大学对高层次人才的培养步入了一个新的发展阶段。学校现有21个研究生培养学院，拥有2个一级学科博士后科研流动站、5个一级学科博士学位授权点、42个二级学科博士学位授权点、22个一级学科硕士学位授权点、132个二级学科硕士学位授权点，拥有教育硕士、艺术硕士、体育硕士、汉语国际教育硕士、翻译硕士、工程硕士6个专业学位类别，硕士、博士招生覆盖32个招生领域，学校现有全日制硕士、博士在校生3200余人，形成了门类齐全、结构合理、特色突出、优势明显的学科格局。
