年成立天主教联盟，由亨利?介斯领导，宣布一切天主教徒必须服从联盟，企图以此夺取王位。但亨利三世利用联盟内部矛盾，依靠城市和普通贵族的支持，宣布自己为天主教联盟首领，并把它改名为“王家联盟”。1585年那瓦尔的亨利正式成为王位继承人，介斯党看到大势已去，于是建立了“巴黎联盟”，积极策划推翻国王。1585年5月，国王逃出巴黎，12月派人刺杀了亨利?介斯，这件事使巴黎反国王的运动十分高涨，那瓦尔的亨利率大军从南方逼近巴黎，国王也于1589年4月联合他共同向巴黎推进，然而8月1日一名多米尼加派修士扎克?克勒芒潜入军营刺杀了国王，于是亨利?波旁即位，但他信仰雨格诺教，天主教徒和巴黎贵族不愿承认他，继续和他作战，亨利四世于是决心改奉天主教。1593年7月23日他重新皈依天主教，得以于1594年3月进入首都成为全国公认的国王。为平息雨格诺教徒的愤怒和结束长期内战，亨利四世于1598年4月13日颁布了南特敕令，宣布天主教为法国国教，恢复天主教的礼拜，没收的土地的财产归还天主教僧侣，而雨格诺教也获得信仰与崇拜自由，有权召集自己的宗教会议和担任国家官职，并为他们保留了100多个要塞作为履行敕令的担保。南特敕令实质上是交战双方的和约，它标志着法国内战的最后结束。由于它承认了新教的信仰自由，所以也是西欧第一个对异教宽容的范例。
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