2005年7月，经河南省人民政府批准，河南大学开始试办研究生院。2010年2月，根据工作需要，经校党委常委会议研究，决定成立“211工程”与省部共建办公室，挂靠研究生院。目前，河南大学已经成为一所拥有文、史、哲、经、管、法、理、工、医、农、教育、艺术等12个学科门类的综合性大学。设有12个博士学位授权一级学科，42个硕士学位授权一级学科，18种硕士专业学位授权类型；文学院、新闻与传播学院、历史文化学院、哲学与公共管理学院、经济学院、法学院、工商管理学院、教育科学学院、外语学院、数学与信息科学学院、物理与电子学院、化学化工学院、计算机与信息工程学院、环境与规划学院、生命科学学院、土木建筑学院、艺术学院、体育学院、医学院、药学院、护理学院、国际汉学院、马克思主义学院、天然药物与免疫工程重点实验室、特种功能材料重点实验室、黄河文明与可持续发展研究中心等26个研究生培养单位。